cbind.dartR	cbind.dartR
gi2gl	gl2gi
gl.add.indmetrics	gl.add.indmetrics
gl.alf	gl.alf
gl.allele.freq	gl.allele.freq
gl.amova	gl.amova
gl.check.verbosity	gl.check.verbosity
gl.check.wd	gl.check.wd
gl.colors	gl.colors
gl.compliance.check	gl.compliance.check
gl.define.pop	gl.define.pop
gl.diagnostics.hwe	gl.diagnostics.hwe
gl.dist.ind	gl.dist.ind
gl.dist.phylo	gl.dist.phylo
gl.dist.pop	gl.dist.pop
gl.document	gl.document
gl.drop.ind	gl.drop.ind
gl.drop.loc	gl.drop.loc
gl.drop.pop	gl.drop.pop
gl.drop.sexlinked	gl.drop.sexlinked
gl.edit.recode.ind	gl.edit.recode.ind
gl.edit.recode.pop	gl.edit.recode.pop
gl.fbm2gen	gl.fbm2gen
gl.fdsim	gl.fdsim
gl.filter.allna	gl.filter.allna
gl.filter.callrate	gl.filter.callrate
gl.filter.excess.het	gl.filter.excess.het
gl.filter.factorloadings	gl.filter.factorloadings
gl.filter.hamming	gl.filter.hamming
gl.filter.heterozygosity	gl.filter.heterozygosity
gl.filter.hwe	gl.filter.hwe
gl.filter.ld	gl.filter.ld
gl.filter.locmetric	gl.filter.locmetric
gl.filter.maf	gl.filter.maf
gl.filter.monomorphs	gl.filter.monomorphs
gl.filter.overshoot	gl.filter.overshoot
gl.filter.pa	gl.filter.pa
gl.filter.rdepth	gl.filter.rdepth
gl.filter.replicates	gl.filter.replicates
gl.filter.reproducibility	gl.filter.reproducibility
gl.filter.secondaries	gl.filter.secondaries
gl.filter.sexlinked	gl.filter.sexlinked
gl.filter.taglength	gl.filter.taglength
gl.fixed.diff	gl.fixed.diff
gl.fst.pop	gl.fst.pop
gl.gen2fbm	gl.gen2fbm
gl.He	gl.He
gl.Ho	gl.Ho
gl.hwe.pop	gl.hwe.pop
gl.impute	gl.impute
gl.join	gl.join
gl.keep.ind	gl.keep.ind
gl.keep.loc	gl.keep.loc
gl.keep.pop	gl.keep.pop
gl.load	gl.load
gl.mahal.assign	gl.mahal.assign
gl.make.recode.ind	gl.make.recode.ind
gl.make.recode.pop	gl.make.recode.pop
gl.map.interactive	gl.map.interactive
gl.merge.pop	gl.merge.pop
gl.pcoa	gl.pcoa
gl.pcoa.plot	gl.pcoa.plot
gl.plot.heatmap	gl.plot.heatmap
gl.plot.snp.density	gl.plot.snp.density
gl.print.history	gl.print.history
gl.prop.shared	gl.prop.shared
gl.propShared	gl.prop.shared
gl.randomize.snps	gl.randomize.snps
gl.read.csv	gl.read.csv
gl.read.dart	gl.read.dart
gl.read.fasta	gl.read.fasta
gl.read.PLINK	gl.read.PLINK
gl.read.silicodart	gl.read.silicodart
gl.read.vcf	gl.read.vcf
gl.reassign.ind	gl.reassign.ind
gl.reassign.pop	gl.reassign.pop
gl.recalc.metrics	gl.recalc.metrics
gl.recode.ind	gl.recode.ind
gl.recode.pop	gl.recode.pop
gl.rename.pop	gl.rename.pop
gl.report.allelerich	gl.report.allelerich
gl.report.allna	gl.report.allna
gl.report.bases	gl.report.bases
gl.report.basics	gl.report.basics
gl.report.callrate	gl.report.callrate
gl.report.diversity	gl.report.diversity
gl.report.excess.het	gl.report.excess.het
gl.report.factorloadings	gl.report.factorloadings
gl.report.fstat	gl.report.fstat
gl.report.hamming	gl.report.hamming
gl.report.heterozygosity	gl.report.heterozygosity
gl.report.hwe	gl.report.hwe
gl.report.ld	gl.report.ld
gl.report.ld.map	gl.report.ld.map
gl.report.locmetric	gl.report.locmetric
gl.report.maf	gl.report.maf
gl.report.monomorphs	gl.report.monomorphs
gl.report.overshoot	gl.report.overshoot
gl.report.pa	gl.report.pa
gl.report.polyploid_heterozygosity	gl.report.polyploid_heterozygosity
gl.report.rdepth	gl.report.rdepth
gl.report.replicates	gl.report.replicates
gl.report.reproducibility	gl.report.reproducibility
gl.report.secondaries	gl.report.secondaries
gl.report.sexlinked	gl.report.sexlinked
gl.report.shannon	gl.report.shannon
gl.report.taglength	gl.report.taglength
gl.sample	gl.sample
gl.save	gl.save
gl.select.colors	gl.select.colors
gl.select.shapes	gl.select.shapes
gl.set.verbosity	gl.set.verbosity
gl.set.wd	gl.set.wd
gl.sim.cross	gl.sim.cross
gl.sim.crosses	gl.sim.cross
gl.sim.genotypes	gl.sim.genotypes
gl.smearplot	gl.smearplot
gl.sort	gl.sort
gl.subsample.ind	gl.subsample.ind
gl.subsample.loc	gl.subsample.loc
gl.subsample.loci	gl.subsample.loci
gl.test.heterozygosity	gl.test.heterozygosity
gl.tree.fitch	gl.tree.fitch
gl.tree.nj	gl.tree.nj
gl.write.csv	gl.write.csv
gl2bayesAss	gl2bayesAss
gl2bayescan	gl2bayescan
gl2bpp	gl2bpp
gl2demerelate	gl2demerelate
gl2eigenstrat	gl2eigenstrat
gl2fasta	gl2fasta
gl2faststructure	gl2faststructure
gl2gapit	gl2geno
gl2gds	gl2gds
gl2genalex	gl2genalex
gl2genepop	gl2genepop
gl2geno	gl2geno
gl2gi	gl2gi
gl2hapmap	gl2hapmap
gl2hiphop	gl2hiphop
gl2paup.parsimony	gl2paup.parsimony
gl2paup.svdquartets	gl2paup.svdquartets
gl2phylip	gl2phylip
gl2plink	gl2plink
gl2related	gl2related
gl2sa	gl2sa
gl2snapper	gl2snapper
gl2structure	gl2structure
gl2treemix	gl2treemix
gl2vcf	gl2vcf
glMean	glMean
glSum	glSum
ind.count	utils.het.pop
matrix2gen	utils.impute
rbind.dartR	rbind.dartR
theme_dartR	theme_dartR
utils.allelic.richness	utils.allelic.richness
utils.basic.stats	utils.basic.stats
utils.check.datatype	utils.check.datatype
utils.collapse.matrix	utils.collapse.matrix
utils.dart2genlight	utils.dart2genlight
utils.dist.binary	utils.dist.binary
utils.dist.ind.snp	utils.dist.ind.snp
utils.flag.start	utils.flag.start
utils.hamming	utils.hamming
utils.heatmap	utils.heatmap
utils.het.pop	utils.het.pop
utils.impute	utils.impute
utils.is.fixed	utils.is.fixed
utils.jackknife	utils.jackknife
utils.n.var.invariant	utils.n.var.invariant
utils.plink.run	utils.plink.run
utils.plot.save	utils.plot.save
utils.read.dart	utils.read.dart
utils.read.fasta	utils.read.fasta
utils.read.ped	utils.read.ped
utils.recalc.avgpic	utils.recalc.avgpic
utils.recalc.callrate	utils.recalc.callrate
utils.recalc.freqhets	utils.recalc.freqhets
utils.recalc.freqhomref	utils.recalc.freqhomref
utils.recalc.freqhomsnp	utils.recalc.freqhomsnp
utils.recalc.maf	utils.recalc.maf
utils.reset.flags	utils.reset.flags
utils.transpose	utils.transpose
utils.vcfr2genlight.polyploid	utils.vcfr2genlight.polyploid
zzz	zzz
[,dartR,ANY,ANY,ANY-method	sub-dartR-ANY-ANY-ANY-method
